Uue hoone, kloostri Santa Clara Коимбре alustati 1649 aastal. Vana klooster, lõpus ehitatud XIII sajandil, oli hävitanud, ja otsustati ehitada uus hoone nunnad tellimuse Püha Chiara.

Projekti kloostri välja benediktiini munk ja kuninglik arhitekt João Турриано, ehituse tegutses eriosakonna ülemana kuninglik arhitekt Матеуш ukselukud Коуто. Uue hoone ei kesta piisavalt kaua. Kui 1677 aastal uus hoone, kloostri, mis sai nimeks kloostri Santa-Clara-a-Nova, ajasid nunn. Aastal 1696 aastal toimus templi pühitsemine.

Peamine portaal klooster kirik kaunistab kuninglik vapp, mis toetavad kaks inglitega. Sisustus templisse sisse loginud barokk. Kirik on üks marcheno, трансепт puudub. Külgmised kabelis ja kodu капеллу kaunistavad 14 запрестольных pilte XVII sajandi stiilis "талья dorada" - kuulusid muster raamitud резного ja золоченого puu. Lisaks uus klooster перевезли haud tuhka kuninganna Изабеллы Portugali, основательницы selle kloostri. Pärast tema abikaasa surma, king Диниша, kuninganna oli коимбрском kloostri Santa Clara kuni surmani ja maeti seal sama. Seetõttu on kohalike elanike seas seda elupaika nimetatakse монастырем kuninganna Изабеллы. Haud tuhka tehtud hõbe ja kristall, mis on lähedal peamine altar kirikus. Kiriku ees seisab mälestusmärk kuninganna Изабелле, teostatud skulptor Antonio Тексейра Лопеш XIX sajandil.

Aastal 1733 asus kloostris olid ehitatud kaetud galeriid renessanss-stiilis. Ehituse neid galeriid tegutses eriosakonna ülemana ungari arhitekt Carlos Мардел.