Esimene ülikool Peche ilmus 1367 a. nagu üks vanim Kesk-Euroopas kuningas Louis Suur, ta läks all ajal türgi okupatsiooni. 1921. aastal endise Ungari ülikooli Bratislavas (seda. Братиславу, ungari : Пожонь ) kolis Pécs, see результатом1982 Janus Паннониус ülikooli ( Janus Паннониус Tudományegyetem, JPTE ).

Esimene ülikool Peche kehtestati Людовиком I Ungari 1367. Просуществовав ühe õppekeskus aastakümnetel 15. sajandi keskel on ta jagatud kahte kooli - õigusteaduse ja teoloogia. Ajal türgi okupatsiooni ülikoolis oli suletud ja avas oma uksed alles 1785. aastal, kui Joseph II liikus Kuningliku Akadeemia üks Дьера on Pecs. 1802. aastal Kuningliku Teaduste tagasi Дьер korraldusel Francis I, ja institutsioonide kõrghariduse Peche ei olnud enne 1833, kui piiskop linna Pecs võõrustas linna senat asutas Peche Akadeemia koos факультетами, õiguse ja filosoofia.

Kaasaegne ülikool, linna Pecs asutati 1912. aastal ja algselt oli Пожонь (praegune Bratislava). Pärast Esimest maailmasõda Пожонь oli анексирован alates Ungari ja 1921 ülikool kolis Pécs, kus ta viibib tänaseni. 1951. aastal medical ülikooli oli eraldatud, ja kuni 2000 oli eraldi asutusega. 1982 ülikool sai nime januse järgi Паннониуса. Tõeline ülikool, linna Pecs loodi 1. jaanuaril 2000, kui ühinemise teel ülikooli januse järgi Паннониуса, Meditsiini ülikooli linna-ja pedagoogilise kolleegiumi.